MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor bescii DSM 6725 plasmid pATHE01

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012036	T	6	6	30	35	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012036	A	6	6	108	113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012036	A	6	6	130	135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012036	A	7	7	150	156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012036	CCT	2	6	379	384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_012036	TCT	2	6	398	403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012036	TTA	2	6	411	416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012036	TGTTAT	2	12	781	792	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012036	TCAA	2	8	809	816	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_012036	CAC	2	6	817	822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_012036	T	6	6	843	848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012036	TATT	2	8	938	945	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012036	T	6	6	961	966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012036	CAGTT	2	10	977	986	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_012036	TGC	2	6	993	998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012036	CTG	2	6	1059	1064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012036	GTT	2	6	1065	1070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012036	TGA	2	6	1121	1126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012036	TAC	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012036	ACG	2	6	1169	1174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012036	TAT	2	6	1193	1198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012036	ACAA	2	8	1210	1217	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_012036	GC	3	6	1899	1904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012036	T	7	7	2018	2024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012036	TCT	2	6	2118	2123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012036	TCG	2	6	2165	2170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012036	AG	3	6	2259	2264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012036	CTT	2	6	2329	2334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012036	GTT	2	6	2375	2380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012036	ATT	2	6	2758	2763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012036	TGTT	2	8	2794	2801	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012036	T	6	6	2800	2805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012036	T	6	6	2810	2815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012036	C	6	6	2822	2827	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_012036	CCG	2	6	2865	2870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_012036	G	6	6	2902	2907	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012036	T	6	6	2947	2952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012036	T	6	6	2958	2963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012036	T	6	6	3013	3018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012036	A	6	6	3032	3037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012036	T	6	6	3078	3083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012036	T	6	6	3087	3092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012036	T	6	6	3096	3101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012036	A	6	6	3108	3113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012036	CCT	2	6	4838	4843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_012036	T	8	8	4858	4865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012036	T	6	6	4941	4946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012036	CAG	2	6	4970	4975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012036	ATCC	2	8	5045	5052	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012036	CTT	2	6	5063	5068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012036	ACC	2	6	5159	5164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_012036	T	8	8	5210	5217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012036	GTC	2	6	5277	5282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012036	TTA	2	6	5544	5549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012036	TAC	2	6	5580	5585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012036	CTG	2	6	5622	5627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012036	T	6	6	5786	5791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012036	TTCT	2	8	5798	5805	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_012036	CT	3	6	5829	5834	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_012036	TTTAT	2	10	5877	5886	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012036	GCA	2	6	5917	5922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012036	A	7	7	5962	5968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012036	GAC	2	6	5970	5975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012036	T	9	9	6003	6011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012036	TGC	2	6	6036	6041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012036	TTG	2	6	6042	6047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012036	ACAAAA	2	12	6049	6060	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_012036	CCT	2	6	8282	8287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.